Фамилия Иотковская — женская форма, указывающая на принадлежность к роду, основа мужской вариант — Иотковский. Она образована по типичной для польской и западнорусской шляхты модели с суффиксом -ский/-ская, который указывает на дворянское или землевладельческое происхождение, а также на связь с географическим названием. Основа фамилии — «Иотко» или «Иотка». Это могло быть уменьшительное от личного имени Иоанн (Иван) в его западнорусской или польской огласовке, где «Ио» переходит в «Ё» или «Йо» (сравните: Ян, Йоан). В белорусской и украинской традиции суффикс -ко часто образует фамилии от имён (Иван → Иванко → Иотко, если допустить редукцию начального слога). Менее вероятно, но возможно, что основа восходит к прозвищу от диалектного «иотка» — так в некоторых говорах называли иву или мелкую рыбу, но это менее убедительно для фамилии с дворянским суффиксом.

Географически фамилия Иотковская тяготеет к западу исторической России: к землям современной Беларуси, Польши, а также к бывшим губерниям Виленской, Гродненской или Минской. Суффикс -ский в этих краях был маркером шляхетского сословия, поэтому предки носительницы фамилии, скорее всего, принадлежали к мелкой или средней шляхте, владевшей хутором или усадьбой с названием вроде Иотки, Иотково. Такие топонимы могли возникнуть от имени владельца (Иотко) или от местного прозвища. В XIX веке, после разделов Речи Посполитой, многие носители фамилий на -ский перешли в мещанское или крестьянское сословие, но первоначальный социальный отпечаток остался.

В написании фамилии обращает на себя внимание начальная буква «И» — она сохраняет старую орфографию, где после согласных в польском и западнорусском письме «Io» передавало звук, близкий к «ё» или «йо». В русском языке эта фамилия нередко произносится с ударением на втором слоге — Ио́тковская, хотя по правилам польской акцентуации ударение могло падать на предпоследний слог. Таким образом, Иотковская — одна из тех фамилий, которые несут в себе следы межъязыкового перехода и сословной истории западнорусских земель.