Фамилия Иотковский — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную или именную версию. Формант -ский указывает на дворянское или шляхетское происхождение, но не обязательно: в XIX веке такую модель активно использовали в духовенстве и среди крестьян, получивших фамилии по названиям мест. Основа Иотк- не даёт очевидного корня в русских именах или нарицательных словах, поэтому логичнее всего искать её на карте.

Наиболее вероятный источник — топоним Иотки или Иотково. Такие названия встречаются в Беларуси и на западе России, в зоне бывшего Великого княжества Литовского. В основе могло лежать личное имя Иот (редкая форма от Иоанн через польское Jan, Jon, или же от библейского Иофам), либо прозвище от диалектного «иотка» — так в некоторых говорах называли небольшую лодку или челнок. Если верна вторая версия, фамилия Иотковский означала «выходец из места, где жили лодочники» или «человек с Лодочного хутора».

Суффикс -ов- в середине (Иотк-ов-ский) типичен для фамилий, образованных от владельческого названия: село Иотково — значит «принадлежащее Иотке». Сам Иотка — это либо уменьшительное от Иот (как Петро → Петрусь, Иот → Иотка), либо прозвище человека, связанного с лодкой. В любом случае, носитель фамилии — скорее всего, потомок того, кто жил в деревне Иотки или приписал себе фамилию по месту службы, если речь о духовенстве.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В современных базах данных она фиксируется единично, в основном в Беларуси и у потомков эмигрантов первой волны. Сословная принадлежность предков могла быть любой: от мелкой шляхты, бравшей фамилию по имению, до крестьян, получивших её при переписи от названия родной деревни. Точных данных об известных носителях нет, что неудивительно для такой редкой фамилии — её история остаётся загадкой, которую можно разгадать только через архивные записи конкретной местности.