Фамилия Ишеевы — один из примеров того, как тюркское имя легло в основу русского дворянского рода. Её корни уходят в XV–XVII века, в среду выходцев из Золотой Орды, печенегов или половцев. Конкретнее, родоначальником считается князь Ишей мурза Барашев, внук знатного князя Акчуры. Имя Ишей (или Ишай) в переводе с тюркского означает «множься, приумножайся, увеличивайся в числе» — типичное имя-пожелание, популярное у казанских татар в XVI–XVII столетиях.

Фамилию образовали по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяли к основам на мягкий согласный или -й. Так из отчества «Ишеев сын» выросла фамилия, закрепившаяся за потомками этого рода. Князь Ишей мурза Барашев за 35 лет службы получил от царя Василия Шуйского грамоту на княжение над конялской мордвой (27 октября 1607 года), а 18 мая 1613 года её подтвердил уже Михаил Фёдорович.

Внуки Ишея — Иван Алмакаевич и Иван (Ибрагим) Алеевич — приняли крещение и служили стольниками в 1690–1692 годах. Их потомки вошли в состав русского дворянства, сохранив фамилию, которая напоминает о тюркских корнях. Многие нерусские по происхождению дворяне вливались в российскую элиту, и фамилия Ишеевы — документально подтверждённый памятник этого процесса, соединяющий восточную антропонимику с русской сословной историей.