Фамилия Ишеева образована от мужского тюркского имени Ишай, которое в переводе на русский язык означает «множься, приумножайся, увеличивайся в числе». Это имя активно употреблялось у казанских татар в XVI - XVII веках. В истории известен татарский, а позднее русский княжеский род татарского происхождения Ишеевых. Он ведет свое начало от внука князя Акчуры, князя Ишея мурзы Барашева, через его сына Исенея мурзы Ишеева Акчурина. Внуки последнего Иван Алмакаевич и Иван (Ибрагим) Алеевич крестились и были стольниками в 1690—1692 годах. Ишей мурза Барашев за свою 35-летнюю службу 27 октября 1607 года был пожалован княжением над конялской мордвой грамотой царя Василия Шуйского, а 18 мая 1613 года данная грамота была подтверждена царем Михаилом Федоровичем. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ишеевых можно лишь на основании генеалогических исследований.