Фамилия Ишенбекова — женская форма, а её мужской вариант — Ишенбеков. Это типичная фамилия тюркского происхождения, и её разбор сразу указывает на регион бытования: Киргизия, юг Казахстана, а также узбекские и таджикские анклавы. Основа здесь — составное имя Ишенбек, которое образовано по продуктивной для народов Центральной Азии модели.

Первая часть, «ишен», восходит к персидскому слову «ишан» — духовный наставник, глава суфийской общины. В тюркских языках это слово закрепилось и как уважительное обращение к святому или просто грамотному человеку. Вторая часть — «бек» (тюркское «бег», «бий») — означает «господин», «князь», «предводитель». Таким образом, имя Ишенбек в целом можно перевести как «господин-наставник» или «князь-ишан». Человек с таким именем, скорее всего, происходил из семьи, где уважали религиозное знание или принадлежали к местной знати.

Суффикс «-ов» (в женской форме «-ова») — это русский патронимический суффикс, который добавили к имени при оформлении фамилии в XIX–XX веках, когда Российская империя, а затем и СССР вводили обязательные фамилии для оседлого и кочевого населения Средней Азии. До этого люди часто обходились личным именем и именем отца (Ишенбек уулу — «сын Ишенбека»). Интересно, что в самой Киргизии фамилия Ишенбекова встречается не так часто, как в соседнем Узбекистане и среди киргизской диаспоры в Таджикистане, что может говорить о миграциях начала XX века.

В отличие от многих русских фамилий, где суффикс указывает на отчество, здесь он просто адаптирует тюркское имя к русской грамматике. Если ваш предок был Ишенбеком, то он, вероятно, был уважаемым в общине человеком — либо религиозным деятелем (ишаном), либо аксакалом, чей авторитет признавали на уровне рода. Версии о происхождении от казахского «ишен» (доверие) менее убедительны, так как в этом случае имя звучало бы как «Сенимбек» или «Нанымбек» — с другим корнем.