Фамилия Ишкильдина образована от тюркско-татарского имени Ишкильде, которое в переводе на русский язык означает «родился (появился) друг, товарищ, ровня». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ишкильдиных можно лишь на основании генеалогических исследований.