Фамилия Избышев — наглядный пример того, как древнерусское прозвище, связанное с домом и хозяйством, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит слово «изба», но не в прямом значении «дом», а в производном — «избыш», которое в диалектах означало либо самого хозяина избы, либо человека, имеющего лишнюю, вторую избу (от глагола «избыть» — остаться, иметь в избытке). Таким образом, прозвище Избыш мог получить и зажиточный крестьянин, владевший не одной постройкой, и тот, кто слыл домовитым хозяином. Суффикс -ев присоединился к основе, оканчивающейся на шипящий звук, по типичной модели: Избыш → Избышев, то есть «сын Избыша».

В ономастике эта фамилия стоит в одном ряду с такими же «домашними» прозваниями, как Избицкий, Избин, Избушев. Однако её отличает редкий корень: если «изба» встречается в фамилиях часто, то форма «избыш» — архаичная и локальная. По данным исторической лексики, слово «избыш» фиксировалось в северных и сибирских говорах, где им называли не только строение, но и «отдельное помещение для скота» или «пристройку». Это даёт основание предполагать, что географически фамилия Избышев могла зародиться в районах Русского Севера или в среде переселенцев за Урал.

Словообразовательная модель проста: прозвище на -ыш (как Малыш, Глупыш, Крепыш) давало яркую характеристику человеку. В случае Избыша прозвище указывало на бытовую черту — либо избыточность (лишняя изба), либо наоборот, нехватку («избыть» в значении «избавиться»). Вторая версия менее вероятна, так как прозвища с негативным оттенком редко ложились в основу долгоживущих фамилий. Правдоподобнее, что Избыш — это уважительное или нейтральное именование хозяина, владеющего добротным домом.

В сословном отношении фамилия Избышев, скорее всего, принадлежала крестьянской или посадской среде. В дворянские родословные книги она не входила, что подтверждает её «земледельческое» происхождение. Сегодня фамилия встречается нечасто, преимущественно в Центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает её локальное происхождение — возможно, от одного родового гнезда, где прозвище Избыш закрепилось за целой семьёй.