Фамилия Ижмяков — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а финно-угорская, и географически привязана к северо-востоку европейской части России. В ней нет ни отчества от крестильного имени, ни прозвища по ремеслу — корень ведёт к гидрониму или топониму.

Разбор суффикса даёт ключ: -яков — это фонетический вариант суффикса принадлежности -аков/-яков (ср. Коряков, Бобряков). Такая модель типична для русских фамилий, образованных от названий рек, озёр или селений: если человек родом с реки Ижмы, его могли прозвать Ижмяк (житель с Ижмы), а его потомки становились Ижмяковыми. Ударение, судя по аналогиям, падает на второй слог: Ижмяко́в.

Главная зацепка — река Ижма. Это левый приток Печоры, протекающий по территории нынешней Республики Коми. Название реки восходит к коми-зырянскому «ыж» — овца, то есть «овечья река». Кроме того, существует город Ижма (с 1975 года — Сосногорск), а также несколько деревень с таким названием. Выходцы из этого края, переселяясь в центральные губернии или на Урал, получали фамилию по месту прежнего жительства.

Версия с личным именем Ижма маловероятна: такого имени нет ни в православных святцах, ни в дохристианском именослове коми. Спорной можно считать гипотезу о связи с тюркским «иж» (след, метка) — она не объясняет суффикса -мяк и не подтверждается географией фамилии. Правдоподобнее всего, что Ижмяков — «речная» фамилия, указывающая на предка-выходца с берегов Ижмы, и в этом её отличие от более частых отчественных или профессиональных фамилий.

Сословная принадлежность носителей не закреплена: Ижмяковы могли быть и государственными крестьянами северных волостей, и мещанами, и священниками — фамилия не даёт подсказки о социальном статусе, только о географических корнях семьи.