Фамилия Ижокин — одна из тех, где корень не бросается в глаза сразу, а суффикс указывает на конкретную модель образования. Она относится к патронимическому типу на -ин, то есть образована от имени или прозвища, оканчивающегося на -а/-я. В основе лежит личное имя Ижока — это уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Исайя или, что чуть реже, от Иоаким. В русской народной среде оба имени давали множество производных: Исай — Исайка — Ижока; Иоаким — Аким — Ижока. Суффикс -ок- в данном случае не уменьшительный, а скорее фамильярно-бытовой, характерный для северных и северо-восточных говоров.

Географически фамилия Ижокин тяготеет к Вологодской и Архангельской областям, а также к Вятке. Это не случайно: в этих краях имя Исайя было популярно среди старообрядцев, а форма Ижока встречается в переписных книгах XVII века как прозвище крестьянина или посадского человека. Например, в документах по Устюгу Великому фигурирует «Ижока Онтонов сын», что прямо указывает на живую обиходную форму. Таким образом, предок носителя фамилии — человек по имени Ижока, вероятно, крестьянин или ремесленник из северных уездов.

Можно предположить и другую версию, хотя она менее вероятна: связь с диалектным словом «ижок» — так в некоторых говорах называли ерша или мелкую рыбу, а также хилого, щуплого человека. Но прозвище от названия рыбы обычно давали по внешнему сходству или поведению, и оно редко образовывало форму на -а (Ижока). Скорее всего, перед нами именно антропонимический корень, а не апеллятивный.

Фамилия не относится к дворянским или широко известным — она бытовала в крестьянской среде, и её носители не оставили заметного следа в истории. Но именно такие фамилии и ценны для локальной ономастики: они сохранили живую речь и народные варианты имён, которые в официальных документах выглядели иначе. Ижокин — это не «сын Ижока», а буквально «Ижокин» как притяжательное прилагательное: чей? — Ижокин, то есть принадлежащий Ижоке.