Фамилия Изофенко — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а греческая, пришедшая через церковную книжную традицию. Модель образования прозрачна: типичный украинский суффикс -енко, указывающий на происхождение по отцу («чей-то сын» или «потомок кого-то»). Вопрос упирается в корень «Изоф-».

Здесь сразу две версии, и одна из них гораздо убедительнее. Первая, слабая: фамилия могла возникнуть от прозвища Изофа (или Изоф), которое, в свою очередь, связано с греческим «изо-» (равный, одинаковый). Но в живой речи такое прозвище маловероятно — оно книжное и абстрактное, не подходит для бытового именования.

Вторая версия, основная: в основе лежит каноническое имя Иосиф. В народном произношении на украинских и белорусских землях имя Иосиф часто редуцировалось до «Изоф» или «Изоф» (через формы Осип, Юзеф, Есип). Отсюда — Изофа, Изофенко. То есть Изофенко — это «потомок Изофа», где Изоф — просторечная форма крестильного имени Иосиф, которое значит «Бог приумножит» (древнееврейское). Это абсолютно типичная модель для украинских фамилий: Ефименко, Иваненко, Изофенко.

Географически фамилия тяготеет к югу и востоку Украины, а также к приграничным районам России. Встречается редко, что указывает на локальное бытование — возможно, в одном-двух сёлах или казачьих станицах. Суффикс -енко окончательно закрепился в XVII–XVIII веках, когда фамилии стали наследственными в среде запорожского казачества и мещанства. Так что предки Изофенко с высокой вероятностью были не дворянами, а свободными военными или крестьянами, чью фамилию записали по отцу — Изофов сын.