Фамилия Кагенова — женская форма фамилии Кагенов. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа фамилии — «Каген». Сразу заметен редкий суффикс -ен-, который в русских фамилиях встречается нечасто. Обычно фамилии образуются с помощью -ов/-ев или -ин, и суффикс -ен- здесь указывает на то, что перед нами не исконно русская модель, а скорее тюркская или кавказская основа, адаптированная русским окончанием.

Скорее всего, фамилия Кагенов происходит от личного имени Каген. В тюркских языках, в частности в казахском и татарском, имя Каген (или Каган) восходит к древнему титулу «каган» — верховный правитель, хан у кочевых народов. Так могли называть мальчика в знак пожелания ему власти или силы. В таком случае фамилия означает «потомок Кагена» или «принадлежащий Кагену». Суффикс -ов превратил тюркское имя в русскую фамилию, что типично для народов Поволжья, Урала и Северного Кавказа, где русское делопроизводство фиксировало местные имена с русскими окончаниями.

Есть и другая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от прозвища, связанного с глаголом «кагать» — в некоторых говорах так называли крик гусей или уток. Но эта гипотеза слабая: прозвище Кага (от крика) почти не встречается в исторических источниках, и суффикс -ен- для таких прозвищ нехарактерен. Поэтому версия с тюркским именем-титулом выглядит убедительнее.

Географически фамилия Кагенов встречается в регионах с тюркским населением — в Татарстане, Башкортостане, а также у казахов. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьян или служилых людей, принявших русскую фамилию по имени предка. Сословная принадлежность могла быть разной, но точных данных об этом нет. Фамилия редкая, и её разбор показывает, как через суффикс и основу можно увидеть путь из кочевой степи в русскую метрическую книгу.