Фамилия Каклимова — женская форма от Каклимов, и её разумнее начинать разбирать не с корня, а с суффикса. Модель на -имов встречается реже, чем массовые -ов и -ин, и почти всегда указывает на тюркское происхождение основы. Такие фамилии образовывали от личных имён, оканчивающихся на -им: Керим, Селим, Ибрагим. Русский суффикс -ов присоединялся к ним, давая Керимов, Селимов. В нашем случае основа — Каклим. Это имя или прозвище не из арабского или персидского списка, а скорее местная, диалектная форма.

Вероятнее всего, Каклим — это искажённое или адаптированное на русской почве имя Касим (или Касыйм). У татар, башкир и других тюркских народов Касим через промежуточные варианты (Каскым, Каккым) мог перейти в Каклым, а затем и в Каклим. Переход «с» в «к» — явление нередкое в живой речи, особенно при заимствовании. Если это так, то значение восходит к арабскому корню «касама» — делить, распределять; Касим значит «делящий», «распределяющий». Вторая, менее вероятная версия: Каклим — от тюркского прозвища, связанного с глаголом «каклы» (крепкий, твёрдый) или «какмак» (бить, ударять). Но имя собственное как источник выглядит убедительнее прозвища.

География фамилии узкая. Каклимовы встречаются преимущественно в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане. Это зона расселения оренбургских и уральских татар, а также башкир. Сословно предки могли быть государственными крестьянами, тептярями или служилыми татарами — фамилия не аристократическая, а народная, из среды, где имя Касим было распространено. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии фиксировались при переписях, когда тюркское имя записывали на слух русские писцы — отсюда и нестандартное написание с «к» и «л».

Сравните с однокоренными: Каклимов звучит иначе, чем Касимов. Касимовых — тысячи, это фамилия от княжеского города Касимов. Каклимов — редкий вариант, который сохранил местное произношение. Носительница фамилии Каклимова может считать, что её фамилия — не испорченная запись, а живой след того, как имя Касим звучало в конкретной татарской или башкирской деревне.