Фамилия Каковкина — женская форма фамилии Каковкин, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени-основе. Словообразовательная модель здесь простая: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Каковкин, то есть сын или потомок Каковки). Основа же — «Каковк(а)» — вызывает вопросы, потому что напрямую в современном русском языке такого слова нет.

Самый вероятный корень — диалектное или устаревшее слово «каковка». В северных и сибирских говорах «каковка» означала «камень», «гальку» или «булыжник». Прозвище Каковка могли дать человеку с твёрдым, неподатливым характером, либо тому, кто жил на каменистой почве или работал с камнем (например, каменотёсу или строителю). Такая версия логична и подкреплена географией: фамилия Каковкин встречается в основном в Вологодской, Архангельской областях и на Урале — регионах, где каменистый ландшафт и каменные промыслы были обычным делом.

Менее вероятна, но возможна связь с личным именем Како — сокращённой формой от крестильного имени Иаков (Яков). В народной речи Иаков превращался в Якова, а уменьшительные варианты вроде Како, Кака — редкие, но фиксируются в исторических документах. В этом случае Каковка — «маленький Како», а фамилия означала бы «сын Каковки». Однако эта версия слабее: имя Како почти не встречается в русской антропонимике, в отличие от обиходных Яков, Яша, Яшка.

Интересно, что фамилия Каковкин — редкая. По переписям XIX–XX веков она не входила в списки распространённых дворянских или купеческих фамилий, а значит, её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Встречается она и в форме Каковкина, и в мужском варианте Каковкин — без вариаций написания, что говорит о том, что фамилия не прошла через сложные бюрократические искажения. Если вы носите эту фамилию, ваши предки, вероятно, жили на севере или востоке России и могли быть связаны с каменным делом или просто получить прозвище за твёрдый нрав.