Фамилия Калеганова чаще всего оказывается вариантом написания фамилии Колеганова. В Поволжье, особенно в мордовской среде, она встречается довольно часто, и эта география — ключ к её происхождению. Скорее всего, в основе лежит мужское имя Колеган — местная, разговорная форма церковного имени Николай (от древнегреческого «победитель народов»). Если это так, то предок носителя фамилии был человеком простого сословия, где такие народные переделки канонических имён были обычным делом.

Однако есть и другая версия, от мирского имени или прозвища Колеган. Тут значения расходятся в зависимости от региона. В Вологодской губернии словом «коляга» называли слякоть и мокрый снег — такое прозвище мог получить ребёнок, родившийся в непогоду. У пермяков «коляга» — это диалектное название брюквы, гибрида репы и капусты. Давая ребёнку «растительное» имя Колеган, родители могли верить, что природа примет его как своего и передаст ему полезные качества этого растения.

Нельзя исключать и финно-угорский след. Есть мнение, что прозвище Колеган произошло от коми-зырянского слова «кальог» — «болтливый». В таком случае родоначальник Калегановых слыл разговорчивым человеком или интересным собеседником. Какая из этих версий верна для конкретной семьи, без генеалогического исследования сказать трудно, но ясно одно: фамилия крестьянская, региональная, с несколькими равноправными корнями — от имени, от погоды, от растения или от черты характера.