Фамилия Каличун — редкий случай, когда географический маркер почти наверняка перевешивает все прочие версии. Её основа — не славянское имя и не ремесло, а топоним: украинское село Каличун (Каличунь) на Ровенщине, в исторической Волыни. Житель этого села или выходец оттуда получал прозвище Каличун, которое затем закрепилось как фамилия. Модель образования проста: суффикс -ун, типичный для украинских и белорусских фамилий (ср. Грицун, Петрун, Шевчун), присоединён к основе названия населённого пункта. Таким образом, Каличун — это типичная «географическая» фамилия, указывающая на место происхождения рода.

Сам топоним Каличун имеет несколько возможных корней. Самая очевидная версия — от украинского «калити» (калить, закалять) или «калика» (калека, странник), но в данном случае правдоподобнее выглядит связь с диалектным словом «калич» — так в некоторых говорах называли глинистую или болотистую почву, а также мелкий кустарник. Село стоит на реке, и название могло отражать особенность местного ландшафта. Менее убедительна гипотеза о тюркском следе (от «калыч» — сабля), так как для Волыни это нехарактерно, и никаких документальных подтверждений такой миграции основы нет.

Фамилия Каличун почти не встречается за пределами западноукраинского региона, особенно в Западной Беларуси и Польше (где её могли записать как Kaliczun). В России она единична и, скорее всего, занесена переселенцами. Суффикс -ун в украинской ономастике часто указывал на принадлежность к определённой местности или на прозвище по действию (бегун, крикун), но здесь он работает именно как патронимический/топонимический формант, а не характеризующий. Носитель фамилии Каличун, скорее всего, потомок крестьянина или мещанина из волынского села, фамилия которого закрепилась в XIX веке при массовом учёте населения. Других версий, заслуживающих серьёзного рассмотрения, у этой фамилии нет.