Фамилия Калимульдинова — женская форма фамилии Калимульдинов, и её разбор стоит начать с финальной части. Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Калимульдинов, то есть потомок человека по имени или прозвищу Калимульдин. Но сама основа явно не славянская, а тюркско-арабская, что сразу выдаёт регион происхождения — скорее всего, Поволжье (Татарстан, Башкортостан) или Средняя Азия.

В основе лежит арабское имя Калимулла (Калимулла), которое состоит из двух частей: «Калим» (говорящий, собеседник) и «Улла» (Аллах). В исламской традиции «Калимулла» — один из эпитетов пророка Мусы (Моисея), означающий «говорящий с Богом». Такие имена нередко давали мальчикам в татарских и башкирских семьях, особенно в среде мулл и религиозных деятелей. Русский суффикс -ов превратил имя Калимулла в фамилию Калимуллин, но в нашем случае форма Калимульдинов — результат диалектного или письменного искажения: скорее всего, от той же основы, но с добавлением -дин (от арабского «дин» — вера, религия). То есть Калимульдинов — «потомок того, кто связан с верой и речью Бога», что звучит как двойное указание на религиозный контекст.

Фамилия редкая, и её носители, вероятно, происходят из среды исламского духовенства или зажиточных крестьян, которые взяли фамилию по деду или отцу с таким именем. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской административной системе — при переписях XIX века или после революции, когда татарам и башкирам массово давали русские окончания. В отличие от более частых Калимуллиных или Калимуллиных, форма Калимульдинов встречается локально, например, в Оренбургской области или в Западном Казахстане.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Калимов, Калимуллин, Калимуратов, — то Калимульдинов выделяется именно вставкой -дин-, что может быть следствием смешения двух арабских корней в одном роду. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано, но для генеалогического поиска стоит обратить внимание на метрические книги мечетей Оренбургской губернии начала XX века — там могли встречаться записи о Калимульдиновых как о муллах или торговцах.