Фамилия Калюсенко — яркий пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, означающий «сын» или «потомок», в XVI–XVII веках был главным маркером украинского именования и закрепился в казацкой среде. В основе фамилии лежит личное имя или прозвище Калюс, которое само по себе требует разбора.

Корень Калюс- восходит, скорее всего, к просторечному варианту имени Калиник (греч. «прекрасный победитель»). В украинской народной традиции это имя преобразовалось в Калюник, а от него — в сокращённую форму Калюс. Подобные усечения (Михайло → Михно, Дмитро → Дмитрус) были нормой в бытовом общении. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «калюс» — колючее растение (чертополох или репейник). В таком случае прозвище могли дать человеку цепкому, неуступчивому или просто живущему в зарослях. Третья версия — происхождение от польского kalus (мозоль), но это маловероятно для украинской антропонимии.

Географически фамилия Калюсенко тяготеет к центральным и восточным регионам Украины, особенно к Полтавщине и Черкасщине — территориям активного формирования казацких фамилий на -енко. В России она встречается редко, в основном как результат миграции в XIX–XX веках.

Сословно носители фамилии относились к казачеству или крестьянству. В реестрах Запорожского войска и переписях Гетманщины подобные фамилии фиксировались как родовые уже в конце XVII века, что говорит о древности и устойчивости линии. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые в украинской среде часто указывали на принадлежность к московскому служилому сословию, Калюсенко — сугубо местная, народная форма.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Калюжный, Калюжко — показывает разницу в суффиксах. Калюжный (от «калюжа» — лужа) указывает на прозвище по месту жительства, а Калюсенко — на патронимический характер. Таким образом, предок современного носителя фамилии — это человек по имени Калюс, чей сын и стал первым Калюсенко.