Фамилия Кананирова — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Кананиров. Её образование прозрачно и типично для русской ономастики: суффикс -ов присоединился к основе, которая восходит к прозвищу или имени Кананир. Ударение, скорее всего, падает на третий слог: Канани́рова.

Корень этой фамилии — один из самых спорных и интересных. Самая вероятная версия связывает его с греческим словом «канони́р» (κανονιέρης) — так в XVIII–XIX веках на русском флоте и в артиллерии называли пушкаря, канонира. Слово пришло через западноевропейские языки (французское canonnier, немецкое Kanonier). В русском языке оно закрепилось в форме «канонир», но в говорах и при устной передаче могло измениться: появилось «кананир» (с «а» в первом слоге под влиянием аканья). Тогда Кананиров — это сын или потомок канонира, артиллериста. Фамилия могла возникнуть в солдатской или матросской среде, где профессиональные прозвища были обычным делом.

Менее распространённая, но не исключённая версия — тюркское происхождение. В некоторых тюркских языках есть корень «кан» (кровь, род) и «ана» (мать), но сложить их в осмысленное личное имя Кананир сложно. Греческая версия выглядит убедительнее, особенно учитывая, что фамилия встречается в регионах, где были расквартированы артиллерийские части или проживали отставные солдаты.

Географически фамилия Кананирова — редкая. Она не входит в списки массовых русских фамилий, и её носители в основном сосредоточены в центральных областях России, с возможными очагами на юге, где исторически была сильна армейская среда. Встречается и вариант Кананиров, но женская форма Кананирова закрепилась в документах как основная.

Таким образом, предок носителей этой фамилии с высокой долей вероятности был военным артиллеристом, канониром, и его прозвище, пройдя через народное произношение, дало начало редкой, но звучной фамилии.