Фамилия Канжегалин — редкая и звучит непривычно для русского уха. Её разбор стоит начать не с привычного суффикса, а с корня, который явно выбивается из славянских основ. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского происхождения, адаптированная русской моделью с суффиксом -ин.

Основа «Канжегал» восходит к тюркскому прозвищу или имени. В тюркских языках (башкирском, татарском, казахском) корень «кан» означает «кровь», а также может входить в состав сложных имён со значением «родня», «единокровный». Вторая часть «жегал» (или «жыгал», «йыгал») может быть искажением от «йегет» (джигит, молодец) или от глагола со значением «сжигать», «жечь». Однако правдоподобнее версия, что «Канжегал» — это вариант имени Канзафар или Канзада, где «зафар» (победа) или «зад» (дитя) под влиянием местного произношения могло трансформироваться в «жегал». В таком случае фамилия значит «кровный победитель» или «дитя крови», то есть родной, близкий человек.

Суффикс -ин указывает на русскую модель образования: «чей?» — Канжегалин, то есть сын или потомок Канжегала. Такие фамилии в Поволжье и Приуралье получали крещёные татары, башкиры и мишари. Если предок носителя фамилии был Канжегалом, это могло быть его личным именем до принятия христианства или уличным прозвищем.

Географически фамилия тяготеет к Оренбургской области и Башкортостану. Встречается она редко, и это указывает на то, что родоначальник был человеком заметным в своей деревне, но фамилия не разошлась широко. Сословно предки Канжегалиных, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, либо к башкирским вотчинникам, нёсшим военную службу. Никаких дворянских корней или громких исторических личностей за этой фамилией не числится — это фамилия простого, но не заурядного человека из тюркской среды, чьё имя со временем обрусело.