Фамилия Капеистов — один из тех случаев, когда написание подсказывает произношение, а не наоборот. В ней отчётливо слышится основа «капеист», и именно она ведёт к разгадке. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Капелистов, где произошло упрощение группы согласных: «л» выпало при произношении, а потом закрепилось и на письме. Такое нередко случалось в просторечии и при невысокой грамотности переписчиков в XIX веке.

Если принять версию с утерянным «л», то основа восходит к слову «капелист» или «капельмейстер». Капельмейстером в дореволюционной России называли руководителя оркестра, чаще военного или крепостного. От него образовалась фамилия Капелистов — по модели «кто служит у капельмейстера» или «сын капельмейстера». Суффикс -ов здесь стандартный, патронимический, указывающий на принадлежность.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с глаголом «капать» или существительным «капель». Тогда «капеист» могло быть прозвищем человека, который вечно капает, льёт воду, либо того, кто работает с каплями (например, аптекарь, изготавливающий капли). Однако в отличие от прозрачного «капельмейстерского» корня, эта версия не имеет устойчивой словообразовательной традиции в русских фамилиях.

Географически фамилия Капеистов встречается редко и в основном фиксируется в центральных регионах России, что косвенно подтверждает её происхождение от военных музыкантов — капельмейстеров, которые были распространены в гарнизонах и помещичьих усадьбах. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) прямого упоминания нет, но модель образования через суффикс -ов от профессии на -ист (капелист, гармонист, баянист) вполне типологична.

Таким образом, Капеистов — это, скорее всего, искажённая форма фамилии Капелистов, а предок носителя был либо самим капельмейстером, либо его подчинённым музыкантом.