Фамилия Капнагуз — редкая и выразительная, сразу привлекающая внимание своей необычной звуковой формой. В ней отчетливо слышится иноязычная, скорее всего тюркская, основа, что делает её происхождение особенно интересным для носителя.

Первый и самый очевидный путь разбора — сложное слово, состоящее из двух частей: «капна» и «гуз». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) «кап» или «капка» означает «мешок», «сумка», а также «крышка», «закрывать». Вторая часть, «гуз» (или «кюз»), чаще всего переводится как «глаз». Таким образом, буквальное значение прозвища Капнагуз — «закрытый глаз» или «мешок глаза». Это могло быть прозвищем человека с прищуренным глазом, с особенностью зрения или с характерной мимикой. В тюркской антропонимии прозвища по физическим недостаткам или особенностям внешности были распространены и не несли оскорбительного оттенка, а служили опознавательным знаком.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает «гуз» с этнонимом «огуз» (одно из древних тюркских племен). В таком случае Капнагуз могло означать «закрытый огуз» или «карманный огуз» — возможно, прозвище человека, который держался особняком или имел отношение к этому племени, но в ироничном смысле. Однако эта гипотеза слабее, так как фонетически «огуз» в составе сложных прозвищ обычно не редуцируется до «гуз».

Фамилия образована без русского патронимического суффикса, что типично для фамилий тюркского происхождения, которые вошли в русский обиход в «застывшей» форме прозвища. Носители фамилии Капнагуз, скорее всего, происходят из регионов с сильным татарским или башкирским влиянием — Поволжья, Приуралья, Оренбуржья. Встречаемость фамилии крайне низкая, что делает её уникальным маркером конкретного, возможно, небольшого рода.