Фамилию Капсаргина стоит разбирать через мужскую форму — Капсаргин. Это типичная русская фамилия с суффиксом -ин, который в классической модели указывает на принадлежность: «чей?» — Капсаргин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Капсарга. Суффикс -ин обычно присоединялся к основам на -а/-я, что здесь и видим.

Основа «Капсарг-» звучит необычно и явно не из церковнославянского или древнерусского именника. Скорее всего, это прозвище, образованное от диалектного или профессионального слова. Самая вероятная версия — связь с глаголом «капсать» или «капсеть», который в некоторых говорах означал «капризничать», «дуться», «хныкать» или «медлить, копаться». Прозвище Капсарга могли дать человеку с медлительным, ворчливым или капризным характером. В пользу этой версии говорит и типичный для прозвищ суффикс -арг(а), который встречается в других русских фамилиях, например, Ковырягин, Шмыргалин.

Менее распространённая, но возможная версия — происхождение от тюркского корня, где «капсар» могло означать что-то вроде «мешок» или «сума» (ср. «капчук» — кошель). Тогда прозвище могло относиться к торговцу, меняле или просто человеку с характерной сумой. Однако для фамилии Капсаргина эта этимология слабее, так как суффикс -арг- в тюркских заимствованиях редок, а звучание ближе к русской диалектной основе.

Географически фамилия Капсаргина встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в старых записях по Вологодской и Архангельской губерниям. Там диалектное слово «капсать» было в ходу. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища закреплялись за одной семьёй на поколения. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно — это «простая» фамилия, но с очень характерным и запоминающимся звучанием.