Фамилия Капташкин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного отчества от крестильного имени, зато есть суффикс -ин, который в русской модели фамилий указывает на принадлежность: «чей?» — «Капташкин», то есть сын или потомок человека по прозвищу Капташка.

Корень «капт-» сразу наводит на мысль о диалектном слове «капта́» — так в некоторых говорах называли тёплую шапку, капюшон или даже женский головной убор (сравните с «капор»). Тогда Капташка — это человек, который носил такую шапку, либо, в переносном смысле, прозвище по характерной одежде. В ономастике это типичный случай: прозвища по головным уборам давали нередко (ср. Шапкин, Колпаков).

Есть и другая, менее очевидная версия. В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, распространено слово «капта» — «мешок», «сума», «кошель». От него могли образовать прозвище Капта (человек с мешком, торговец, запасливый). Уменьшительная форма Капташка и фамилия Капташкин тогда уходят корнями в татаро-монгольскую или булгарскую среду, что для Поволжья и южнорусских земель исторически правдоподобно. Суффикс -ин в данном случае не противоречит тюркской основе: многие фамилии русского типа на -ин образованы от тюркских прозвищ (Алтышкин, Башкин).

Третья, совсем слабая гипотеза связывает фамилию с глаголом «каптать» — якобы «закрывать, укрывать» (диалектное слово, зафиксированное в северных говорах). Но это скорее народная этимология: глагол редок, и фамилий от него почти не встречается.

Географически фамилия Капташкин не привязана к одному региону: она встречается и в центральной России, и в Поволжье, и на Урале. Это говорит о том, что прозвище было распространено довольно широко, но фамилия осталась малочисленной — возможно, её носители не составляли большого крестьянского рода или были выходцами из однодворческих и служилых слоёв, где фамилии закреплялись позже.

Известных исторических носителей фамилии нет в общероссийских справочниках, что типично для редких фамилий. По сословной принадлежности Капташкины могли быть крестьянами или мещанами — суффикс -ин чаще встречается именно в этих средах, в отличие от дворянских фамилий на -ов.

Таким образом, наиболее вероятное значение фамилии Капташкин — «потомок Капташки», где Капташка — либо человек в капюшоне/шапке (от «капта»), либо выходец из тюркской среды с прозвищем от слова «мешок». Вторая версия интереснее, но обе имеют право на существование.