Фамилия Карахтанова — редкий случай, когда основа слова почти наверняка восходит к тюркскому корню, а русский суффикс при этом нестандартно прикреплён. Разберёмся, как это получилось.

В основе лежит слово «карахтан» или «карахта». В татарском, башкирском и казахском языках «кара» означает «чёрный», «тёмный». Вторая часть может восходить к «хтан» (от «хтан» — «гусь» или «птица») или к диалектному «ахта» — «кастрированный». Получается прозвище Чёрный Гусь либо Чёрный Кастрат (в значении «холостяк», «одинокий»). Оба варианта — типичные для тюркских народов двусоставные имена-прозвища, которые давали по внешности или по характеру.

Модель образования фамилии необычна. Обычно из тюркского прозвища делали русскую фамилию через суффикс -ов/-ев: Карахтанов. Форма Карахтанова — это женский вариант, но в русской традиции фамилии на -ов/-ев склоняются по мужскому роду: Карахтанов. Женский вариант Карахтанова — это форма родительного падежа («жена Карахтанова»), которая закрепилась как фамилия. Такое встречается реже, но бывает, особенно в южнорусских и казачьих областях, где фамилии на -ова могли фиксироваться в документах как исходная форма для женщин.

Географически фамилия встречается в Поволжье и на Южном Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это совпадает с зоной расселения татар и башкир, где такие прозвища были в ходу. Предки Карахтановых, скорее всего, были крещёными татарами или башкирами, которые перешли в православие и получили фамилию по старому родовому имени.

Есть и менее вероятная версия: от русского диалектного глагола «карахтаться» (суетиться, возиться). Но она слабая — глагол редкий, а фамилия явно тяготеет к тюркскому ареалу. Поэтому основной остаётся версия с «чёрным гусём» или «чёрным холостяком».