Фамилию Караксина чаще всего выводят из прозвища Каракса. Его основа — эрзянское слово «каракш», что значит «глаз». Прозвище могли дать человеку за большие глаза или, наоборот, за привычку глазеть по сторонам, то есть зеваке и любопытному. В языке произошла замена звука «ш» на «с», и «Каракша» превратилось в «Каракса». Так прозвище закрепилось как обиходное имя, а затем легло в основу фамилии Караксин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Караксы. По этой же модели образованы десятки русских фамилий от прозвищ и мирских имён (Сорокин, Птицын). В фамилии Караксина ударение, скорее всего, падает на второй слог — Ка-ра́-кси-на, хотя в разных говорах возможны смещения.

География фамилии узкая. По открытым данным, основные носители сосредоточены в Поволжье — в Мордовии, Нижегородской и Самарской областях. Это совпадает с территорией расселения эрзи и мокши, что подтверждает финно-угорское происхождение корня. Встречаемость фамилии невысокая, она относится к редким.

С точки зрения словообразования фамилия Караксина примечательна тем, что в основе лежит не тюркский корень (как можно было бы предположить из-за созвучия с «кара» — чёрный), а именно эрзянский. Это редкий случай, когда мордовское слово дало фамилию, адаптированную русским суффиксом. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) аналогичные примеры с финно-угорской основой встречаются, но нечасто. Поэтому Караксина — не просто фамилия, а языковой мостик между эрзянским прозвищем и русской патронимической традицией.