Фамилия Карапаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Карапаев уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Карапаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Карапаев восходит к обрядовому, фольклорному имени Карабай, которое распространено у татар и башкир. Имя Карбай переводится с тюркского как «сильный, мощный бай» и «смуглый мальчик». У татар, башкир и других тюркских народов оно употреблялось также как кличка, которую давали темно-шерстным собакам. В настоящее время это имя практически не употребляется, но оно сохранилось в фамилии Карабаев у казанских татар и в фамилии Карапаев – у татар, проживающих в Астрахани. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Карапаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Карапаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.