Фамилия Каркунов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. По одной из версий, прозвище Каркун происходит от глагола «каркать». Согласно другой гипотезе, прозвище Каркун восходит к белорусскому глаголу «каркаваць» — «закупоривать (бутыль)». Наконец, не исключено, что прозвище Каркун связано с западнославянским «карк», т.е. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Каркун, со временем получил фамилию Каркунов. О точном месте и времени возникновения фамилии Каркунов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Каркунов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.