По одной из версий, прозвище Каркун происходит от глагола «каркать». Согласно другой гипотезе, прозвище Каркун восходит к белорусскому глаголу «каркаваць» — «закупоривать (бутыль)». Наконец, не исключено, что прозвище Каркун связано с западнославянским «карк», т.е. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Каркун, со временем получил фамилию Каркунова.