Фамилия Карлушина — женская форма фамилии Карлушин, и её почти всегда рассматривают в паре с исходным мужским вариантом. Основа здесь — имя Карл, которое в русскую бытовую среду попало не напрямую из германских языков, а скорее через польское или украинское посредничество. В XVII–XVIII веках, особенно после Северной войны и разделов Речи Посполитой, в русских землях появилось немало выходцев с запада, носивших имя Карл или его производные. В народной среде это имя быстро обросло уменьшительными формами: Карлуша, Карлуха, Карлушка. Суффикс -уш- типичен для ласкательных прозвищ (сравните: Ванюша, Петруша), и именно от формы Карлуша и пошла фамилия.

В словообразовательной модели Карлушин — это типичный «ичневый» патроним, только не на -ович/-евич, а на -ин, что в крестьянской и мещанской среде было нормой. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Карлушин, то есть сын или потомок Карлуши. Если бы фамилия образовалась напрямую от полной формы Карл, мы бы получили Карлов или Карлович. Вариант на -уша говорит о том, что предок носителя фамилии в быту звался неофициально, ласково или пренебрежительно — Карлуша. В некоторых говорах «карлуша» могло быть и прозвищем человека маленького роста (от «карлик»), но это менее вероятно, так как имя Карл давало готовую и понятную основу.

Географически фамилия Карлушин (и Карлушина) встречается нечасто и тяготеет к регионам, где в XIX веке были поселения немецких колонистов или активные контакты с поляками: Поволжье, юг Украины, Новороссия. В центральных русских губерниях она редка. Встречаются также варианты с ударением на первый слог (Ка́рлушин) и на второй (Карлу́шин) — это может указывать на разное происхождение: в первом случае ударение падает на корень имени, во втором — на суффикс прозвища.

С социальной точки зрения, носители фамилии Карлушин в основном относились к крестьянскому или мещанскому сословию. Дворянских родов с такой фамилией в «Общем гербовнике» нет. В метрических книгах XIX века Карлушины встречаются среди государственных крестьян и однодворцев, что косвенно подтверждает версию о происхождении от личного прозвища, а не от знатного рода.

Резюмируя: фамилия Карлушина — это матроним или патроним от ласкательной формы имени Карл, распространённой в западнорусских и малороссийских землях. Предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком незнатного происхождения, которого в округе знали как Карлушу — либо по имени, полученному при крещении, либо по прозвищу, данному за небольшой рост.