Фамилия Кашаганов образована от тюркского имени или прозвища Кашаган. Точное значение исходного слова неоднозначно, и здесь стоит разобрать две основные версии, опираясь на тюркскую ономастику.

Первая и наиболее вероятная версия связывает основу «каша» с тюркским словом, означающим «бровь». В этом случае Кашаган — человек с густыми, сросшимися или приметными бровями. Прозвища по внешним признакам (особенно по форме или цвету бровей, усов, бороды) были распространены у тюркских народов и легко закреплялись в качестве фамилий. Вторая версия выводит имя от тюркского «каш» — «драгоценный камень», «яшма». Тогда Кашаган могли назвать ребёнка, желая ему ценности и твёрдости, или же прозвище получил ювелир, торговец камнями. Однако первая версия выглядит правдоподобнее, так как прозвища по чертам лица встречаются чаще, чем метафорические имена с корнем «каш».

Фамилия образована по русской модели с помощью патронимического суффикса -ов, который присоединяется к тюркской основе. Это типично для фамилий, возникших в среде татар, башкир, казахов и других народов, вошедших в состав Российской империи. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Кашагана».

Географически фамилия Кашаганов тяготеет к регионам с тюркским населением — к Башкортостану, Татарстану, Оренбургской, Челябинской областям, а также к Казахстану. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении: скорее всего, один род или несколько семей в определённой местности дали начало всем носителям. Фамилия не имеет отношения к славянским корням — это чистый пример тюркского имени, адаптированного русским суффиксом.

С точки зрения социального контекста, предки Кашагановых в XIX веке, вероятно, относились к крестьянскому или мещанскому сословию. В среде татарских и башкирских крестьян фамилии на -ов закреплялись массово после отмены крепостного права, когда потребовалось учесть население. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно — она осталась в народной среде.