Фамилия Каушнян — редкий случай, когда географическое происхождение почти очевидно, а смысл основы приходится реконструировать по косвенным данным. Типичный армянский суффикс -ян (в старой орфографии -янц) указывает на принадлежность к роду: «из рода Каушн» или «потомок Каушна». Вопрос упирается в то, что такое или кто такой «Каушн».

Скорее всего, в основе лежит армянское слово «кауш» (գաւշ), которое в диалектах означает «глухой», «тугой на ухо». Это классическая модель: прозвище по физической особенности перешло на потомков. Подобные фамилии — Глухов, Глушков, Глушанин — встречаются у всех народов, но в армянской среде оглушение слуха закрепилось именно в форме «кауш». Менее вероятно, но допустимо, что Каушнян восходит к топониму вроде села Каушут (Армения) или к тюркскому «кауш» (схватка, борьба) — такие заимствования в армянском быту случались, но фонетически они менее убедительны.

Суффикс -нян вместо обычного -ян — не ошибка, а диалектный или фамильный вариант, характерный для некоторых регионов исторической Армении, например, для Западной Армении или диаспоры. Встречаются фамилии и на -нц, и на -нянц, и на -нян; Каушнян — одна из таких локальных форм, которая могла закрепиться в письменных документах XIX века при русификации.

В Российской империи фамилия распространена слабо, единичные носители фиксируются в Закавказье и среди армянской диаспоры юга России (Краснодарский край, Ростовская область). Сословная принадлежность не прослеживается: Каушнян мог быть и крестьянином, и ремесленником, и священником — прозвище «глухой» не несёт социальной окраски.

Итог: фамилия Каушнян образована от прозвища Каушн (глухой) с помощью армянского патронимического суффикса -ян в диалектной форме -нян. Предок носителя, скорее всего, был армянином из Западной Армении или приграничных районов, получившим прозвище из-за слабого слуха.