Фамилия Кердяйкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка было не русским, а тюркским или финно-угорским. Чтобы понять её корень, нужно смотреть не на привычные славянские модели, а на географию бытования.

Большинство носителей этой фамилии — из Поволжья, особенно из Мордовии, Чувашии и соседних областей. В тюркских языках (татарском, башкирском) есть слово «кердяй» или близкие к нему звучания, означающие «корявый», «кривой», «с изъяном». Прозвище Кердяй могли дать человеку с физическим недостатком — например, кривой рукой или ногой, косым глазом. В чувашском языке есть слово «кӗрт» — «входить», «вваливаться», но более вероятна именно первая, описательная версия.

Суффикс «-кин» в фамилии — не уменьшительно-ласкательный, а притяжательный, характерный для северных и восточных русских говоров, где он вытеснил более южный «-ов». Кердяйкин буквально означает «чей?» — «сын Кердяя» или «человек из рода Кердяя». В XVI–XVII веках такие прозвища часто фиксировались у служилых татар и крещёных чувашей, которые несли сторожевую службу на юго-восточных рубежах Московского государства.

Интересно, что фамилия почти не встречается за пределами Среднего Поволжья. Это указывает на локальный характер прозвища: оно не стало популярным общерусским именем, а осталось в среде, где тюркские диалекты были повседневными. В документах XVII века можно найти похожие формы — Кердяев, Кердяков, — но Кердяйкин — именно с тем суффиксом, который выдает региональную особенность: так образовывали фамилии в Нижегородском Заволжье и на территории современной Мордовии.

Итог простой: предок носителя фамилии Кердяйкин — человек, получивший прозвище по внешнему признаку, скорее всего, из тюркоязычной среды Поволжья, а сама фамилия закрепилась в форме, типичной для северо-восточной модели образования.