Фамилия Керхмеер звучит для русского уха необычно, и это сразу подсказывает её происхождение. Она явно не из славянского именослова, а из немецкого или голландского языков. В основе лежит сложное слово, которое можно разобрать на две части: «Керх» и «меер». Вторая часть, «меер» (Meer), с немецкого и нидерландского переводится как «море» или «озеро». Первая часть, «Керх», скорее всего, является искажённым вариантом слова «Кирх» (Kirche — церковь) или «Керк» (Kerk в нидерландском — то же самое). Таким образом, исходное прозвище или название места могло означать «церковь у моря» или «церковное озеро». Фамилия, скорее всего, образована от топонима — названия поселения, стоявшего на берегу озера или моря рядом с церковью.

Важно отметить, что в немецкой ономастике фамилии, оканчивающиеся на «-меер», обычно указывают на человека, жившего у воды. Сочетание с «Керх» встречается реже, что делает фамилию не слишком распространённой. Написание «Керхмеер» с буквой «е» после «р» — это русская транскрипция. В оригинале фамилия могла писаться как Kerchmeer, Kirchmeer или, в более привычном варианте, Kirchmeier. Последняя форма, «Кирхмайер», более известна и означает «церковный управляющий» или «арендатор церковной земли». Но в фамилии Керхмеер акцент смещён на географический признак, а не на должность.

Носители такой фамилии, оказавшись в Российской империи, скорее всего, были выходцами из немецких колонистов, которых приглашали осваивать Поволжье и Новороссию в XVIII–XIX веках. Среди них встречались ремесленники, крестьяне и пасторы. Фамилия могла также принадлежать обрусевшим прибалтийским немцам или голландцам, переселившимся в Россию ещё при Петре I. В любом случае, предок человека с фамилией Керхмеер был, по всей вероятности, жителем небольшого приозёрного или приморского селения, где главной приметой была церковь.

С точки зрения словообразования, это типичная немецкая локативная фамилия без какого-либо русского суффикса. Она не склоняется по падежам в мужском роде в русском языке, если считать её иноязычной, но в бытовой речи часто склоняется: «нет Керхмеера», «поговорить с Керхмеером». Встречаются также варианты написания через «и» — Кирхмеер, что подтверждает связь с церковным корнем.