Фамилия Кирхмеер — почти наверняка немецкая по происхождению, и ее разбор стоит начать не с корня, а с географии. Она составная: первая часть «Кирх» (Kirch) восходит к немецкому die Kirche — «церковь», вторая «меер» (Meer) означает «море». Буквально — «церковное море» или «морская церковь». Звучит странно, но это не прозвище, а скорее всего, топонимическая фамилия: так могли назвать человека, жившего у церкви, которая стояла на берегу моря или вблизи водоема. В немецком языке слово «Meer» может также входить в состав названий населенных пунктов (например, Merseburg исторически писался как Merseburg, но с корнем «meri» — озеро, море).

Суффикса, типичного для русских фамилий, здесь нет — фамилия пришла в готовом виде. В России она могла появиться вместе с переселенцами из Германии в XVIII–XIX веках, когда Екатерина II приглашала колонистов осваивать Поволжье и Новороссию. Немецкие фамилии с «Кирх» (Кирхгоф, Кирхнер) в тех краях не редкость. Второй элемент «меер» встречается реже, но указывает на возможную связь с балтийским побережьем или Северным морем — оттуда родом многие меннониты и лютеране, оседавшие в Российской империи.

Есть и более прозаичная версия: в немецком языке существует слово «Kirchmeier» — так называли управляющего церковным хозяйством или старосту при кирхе. С течением времени написание могло исказиться: «Meier» (управляющий, фермер) перешло в «Meer» из-за диалектного произношения или ошибки писаря. Тогда Кирхмеер — это не про море, а про должность: «церковный управитель». Эта гипотеза выглядит правдоподобнее, потому что фамилии на -meier в немецкой ономастике массовы, а «море» в качестве второго компонента — исключение.

В дореволюционных метрических книгах по Саратовской и Самарской губерниям встречаются Кирхмейеры и Кирхмееры — это один и тот же род, чье написание разошлось из-за неграмотности местных писарей. Если ваш предок был из поволжских немцев, то, скорее всего, он носил не образное прозвище, а фамилию по занятию: управлял церковным имуществом или арендовал землю при кирхе.