Фамилия Кэркилан — редкий случай в русском ономастиконе. Прежде всего бросается в глаза нехарактерное для русских фамилий окончание -ан. В исконно русских фамилиях такой суффикс почти не встречается (за исключением нескольких, вроде Шарапов или Полупанов, где он иной по происхождению). Скорее всего, перед нами фамилия, пришедшая из тюркских или, что вероятнее, из финно-угорских языков. В финском, карельском и эстонском суффикс -lan (-lä) обозначает принадлежность к месту или роду: так образуются названия хуторов, деревень и фамилии от них. Например, финская фамилия Киркилан (Kirkilan) могла бы означать «из места, связанного с церковью» (kirkko — церковь). В русском языке фамилия могла быть записана на слух, с характерным смягчением «к» перед «э» и заменой финского долгого гласного на русское «и».

Основа «Кэрки» — скорее всего, искажённое или диалектное произношение слова «церковь» или «кирха». В северо-западных говорах, особенно в Карелии и Ингерманландии, финское kirkko могло звучать как «керкко» или «кэрккё». Отсюда и прозвище человека, жившего у кирхи или служившего при ней. Другая версия, менее вероятная, связывает основу с коми-зырянским «керка» (изба, дом). Но суффикс -lan указывает скорее на прибалтийско-финскую традицию.

Таким образом, носитель фамилии Кэркилан — потомок выходцев из финно-угорской среды, вероятно, с территории современной Карелии или Ленинградской области. Предок мог быть крестьянином или ремесленником, жившим возле церкви, либо получил фамилию по названию хутора. В русских документах XVIII–XIX веков такие фамилии часто русифицировали, добавляя окончание -ов, но вариант Кэркилан сохранился в исходной, «сырой» записи, что делает её ценной для историков диалектов и миграций.