Фамилия Кейстере — редкий случай, когда носитель почти наверняка может определить регион происхождения предков, не заглядывая в архивы. Это латышская фамилия, и её окончание -e указывает на женский грамматический род в латышском языке. Однако в русском контексте фамилия закрепилась в форме Кейстере (не склоняясь по правилам латышского), а её основа восходит к немецкому или нижненемецкому корню.

Вероятнее всего, в основе лежит немецкое слово «Käster» или «Köster» — так в северной Германии и Прибалтике называли церковного служителя, пономаря или ризничего. В латышском языке это слово трансформировалось в «ķesteris» (кистерис), что означает «церковный служка» или «дьячок». Фамилия Кейстере — это латышский вариант, образованный от этой профессиональной основы. Суффикс -e в латышских фамилиях часто указывал на принадлежность к лицу или месту, но здесь он просто оформил заимствованное слово в женский род, что типично для многих латышских фамилий (ср. Калныньш — Калныня, Озолиньш — Озолиня). Таким образом, предок носителя фамилии Кейстере был, скорее всего, латышом или ливом, который служил при лютеранской или католической церкви в Курляндии или Лифляндии.

В Российской империи после отмены крепостного права в Прибалтике латышские крестьяне активно получали фамилии, и многие из них были образованы от профессий, в том числе церковных. Фамилия Кейстере могла возникнуть в конце XIX века, когда латыши начали оформлять паспорта. Встречаются также варианты написания: Кейстер, Кейстэр, но форма с окончанием -е характерна именно для женской линии или для тех, кто записывал фамилию без учёта латышской грамматики.

В современной Латвии фамилия Кейстере встречается, но не массово. В России она крайне редка и может указывать на латышские корни семьи, переселившейся в Сибирь или центральные губернии в ходе столыпинских реформ или депортаций. Единственная деталь, которая отличает эту фамилию от похожих: она не имеет славянских суффиксов (-ов, -ин), поэтому её носитель с высокой долей вероятности не русский по происхождению, а потомок прибалтийских немцев или латышей, принявших фамилию от немецкого слова.