Фамилия Хабелькаева — редкая и сложная по составу, её разбор требует внимания к суффиксальной модели и возможной основе. Слово явно делится на корень «Хабель-», суффикс «-ка-» (или «-к-» с последующим «-а-») и типичный для русских фамилий суффикс «-ев-», а также окончание «-а», указывающее на женскую форму. Мужской вариант — Хабелькаев.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими или кавказскими корнями. Основа «Хабель» может восходить к мужскому личному имени Хабил (араб. Кабиль, библейский Авель), распространённому у народов, исповедующих ислам. В этом случае фамилия означает «потомок Хабила». Суффикс «-ка-» в тюркских и кавказских языках часто выполняет уменьшительную или уничижительную функцию, а в русской передаче мог закрепиться как часть основы. Сравните с фамилиями Хабибуллин, Хабиров — они образованы от того же корня, но с другими формантами.

Вторая, менее вероятная версия — от прозвища. В некоторых говорах «хабель» могло означать нечто связанное с хабаром (барыш, взятка) или быть искажением от «хабалка» (грубая женщина). Но в таком случае суффикс «-ка-» выглядел бы избыточным: фамилия от прозвища Хабалка дала бы Хабалов или Хабалкина, а не Хабелькаев.

Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу и Поволжью, где смешение русского и тюркского населения породило много подобных гибридных форм с суффиксами «-ев» и «-ка». В документах XIX века встречаются записи «Хабелькаев» среди крестьян Ставропольской губернии и казаков Терской области. Это указывает на возможную сословную принадлежность предков к государственным крестьянам или казачеству, а не к дворянству.

Таким образом, носитель фамилии Хабелькаева с высокой вероятностью происходит из семьи, где предка звали Хабил (Авель), а фамилия оформилась уже при переходе в русскоязычную среду через добавление характерного суффикса.