Фамилия Хабышев — один из тех случаев, когда корень слова сразу вызывает вопросы. В русском языке нет общеупотребительного слова «хабыш» или «хабыша». Поэтому объяснение лежит либо в диалектной лексике, либо в тюркских языках, либо в личных именах.

Самый вероятный путь — от тюркского прозвища или имени. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть основа «хаб» или «хабыш», связанная с понятиями «хватать», «брать», «получать». «Хабыш» могло означать «хваткий», «цепкий», «тот, кто умеет взять своё». В переносном смысле — прозвище ловкого, предприимчивого человека или, наоборот, прижимистого. Встречается и личное имя Хабыш, которое давали с пожеланием, чтобы ребёнок был «хватким» к жизни, удачливым в делах.

Суффикс «-ев» указывает на русскую модель образования фамилии от основы на мягкий согласный или на шипящий (Хабыш → Хабышев). Это типичный патроним: «сын Хабыша». Такая форма характерна для регионов, где русское население долго и плотно контактировало с тюркским — Поволжье, Приуралье, юг Сибири. Фамилия Хабышев встречается в Татарстане, Башкортостане, в Оренбургской и Челябинской областях, что подтверждает эту географию.

Менее убедительная версия — от русского диалектного слова «хабыш» в значении «огрызок», «обрубок», «нечто грубое и неотёсанное». Но у этой гипотезы мало лингвистической поддержки: в говорах такое слово не зафиксировано как распространённое. Версия с тюркским «хватким» прозвищем выглядит намного естественнее.

Таким образом, предок носителя фамилии Хабышев, скорее всего, получил прозвище Хабыш за свой характер — цепкий, упористый, умеющий добиваться цели. Фамилия — не дворянская и не крестьянская в сословном смысле, а типичная для служилых людей «по прибору» или ясачных крестьян, которые жили на стыке культур и принимали русские фамильные формы.