Фамилия Хабышева — женская форма, мужская — Хабышев. В основе фамилии лежит прозвище или имя Хабыш, которое само по себе требует расшифровки. Слово «хабыш» не встречается в современном русском литературном языке, но хорошо прослеживается в диалектах и родственных языках.

Скорее всего, корень восходит к тюркским языкам, где «хаб» или «каб» означает «мешок», «сума», а также «схватывать», «хватать». В тюркских наречиях «хабыш» могло быть прозвищем запасливого, прижимистого человека или, наоборот, того, кто носил с собой большой мешок (например, торговца или странника). В русских говорах (особенно южных и уральских) слово «хабыз» или «хабыш» фиксируется в значении «неопрятный человек», «неряха», что тоже могло стать источником прозвища.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе на твердый согласный (-ш) добавляется суффикс принадлежности -ев (вариант -ов после шипящих). Фамилия означает «сын Хабыша» или «из семьи Хабыша». Географически фамилия встречается в основном на юге России и в Поволжье — в зоне активных русско-тюркских контактов. Встречаются варианты написания: Хабышев, Хобышев, Кабышев. Последний вариант (Кабышев) распространен шире и иногда считается исходным, но чередование «к/х» в тюркских заимствованиях — обычное дело (ср. кабак/хабак, кабан/хабан).

Сословная принадлежность носителей фамилии точно не установлена, но судя по характеру основы (прозвище, а не крестильное имя), предки Хабышевых относились к крестьянам или посадским людям, а не к дворянству. В дореволюционных источниках фамилия встречается в записях мещан и государственных крестьян из Казанской, Симбирской и Астраханской губерний. Таким образом, Хабышева — фамилия с прозрачной тюркской этимологией, указывающая на прозвище предка, связанное либо с его характером (прижимистость, неряшливость), либо с родом занятий (торговля, перевозка товаров в мешках).