Фамилия Халилулин восходит к арабскому имени Халилулла, которое переводится как «любимец Аллаха» или «друг Бога». Это не просто красивое словосочетание, а один из важнейших эпитетов в исламской традиции. Изначально так называли пророка Ибрагима (библейского Авраама), который, согласно Корану, бесстрашно проповедовал веру в единого Всевышнего и открыто выражал ненависть к безбожию и идолопоклонству. За эту твёрдость и преданность он и получил почётное звание Халилулла.

Русская фамилия образовалась по классической модели: к восточному имени Халилулла добавили русский суффикс принадлежности -ин, который указывает на родство по отцу. Таким образом, Халилулин буквально означает «сын Халилуллы» или «из рода Халилуллы». В тюркских языках, где это имя также было широко распространено, конечный гласный «а» часто отпадал, поэтому основа приняла форму «Халилул», а затем и вовсе упростилась до «Халилу» в произношении, что и закрепилось в письменном варианте фамилии.

Стоит обратить внимание на редкий для русских фамилий случай, когда в основе сохранилось полное теофорное имя с элементом «Аллах». В большинстве аналогичных фамилий (например, Габдуллин или Абдуллин) используется усечённая форма. Здесь же мы видим почти без изменений цельное арабское словосочетание, что делает фамилию Халилулин заметной даже на фоне других фамилий мусульманского происхождения.

Носители фамилии чаще всего встречаются в Татарстане, Башкортостане и среди татарских общин в других регионах России. Это связано с тем, что имя Халилулла было особенно почитаемо в тюрко-мусульманской среде Поволжья и Приуралья. Предки современных Халилулиных, скорее всего, были глубоко верующими людьми, и давая ребёнку такое имя, родители надеялись, что он унаследует от пророка Ибрагима стойкость духа, честность и преданность своим убеждениям.

Встречаются и варианты написания фамилии — Халилуллин с двойной «л» на стыке корня и суффикса. Оба варианта имеют право на существование, но форма с одной «л» встречается чаще и считается более устоявшейся в русскоязычных документах. При этом исходное арабское имя в Коране пишется именно с удвоенной согласной, что иногда вызывает путаницу при оформлении официальных бумаг.

Фамилия не имеет отношения к какому-либо ремеслу или сословию — она чисто патронимическая, то есть образованная от личного имени отца. Это значит, что среди Халилулиных могли быть и крестьяне, и купцы, и муллы — фамилия не выдаёт социального статуса, зато точно говорит о религиозных и культурных корнях рода.