Фамилия Халимуллина — женская форма фамилии Халимуллин, и её разбор лучше начать с конца, с суффикса. Формант -ин — один из самых распространённых русских патронимических суффиксов, указывающих на принадлежность: «чей?» — Халимуллин, то есть сын Халимуллы. Такая модель типична для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а, -я. В данном случае основа — арабское мужское имя Халимулла.

Имя Халимулла составное, из двух корней: «Халим» (от арабского حليم — «кроткий», «терпеливый», «снисходительный») и «Аллах» (Бог). Полное значение — «Кроткий раб Аллаха» или «Снисходительность Бога». Это теофорное имя, то есть включающее в себя имя Всевышнего, что характерно для мусульманской традиции. В татарской, башкирской, казахской среде такие имена давали, выражая надежду на божественные качества в ребёнке или подчёркивая преданность вере.

Географически фамилия Халимуллина (и Халимуллин) наиболее частотна в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, а также среди татарской диаспоры в других регионах России. Это прямо указывает на тюрко-мусульманское происхождение, преимущественно татарское или башкирское. Сословно предки носителей фамилии могли быть как крестьянами, так и муллами или торговцами — имя не несло социальной окраски, а лишь религиозную.

Любопытная деталь: в русских документах XIX — начала XX века фамилию могли записывать с вариациями — Халимулин, Халимуллин, а иногда и Халимулаев, если писарь «обрусел» окончание. Но форма с удвоенной «л» (Халимуллин) точнее передаёт арабскую графику имени, где «лла» — это стяжение «Аллах». Так что двойная «л» в фамилии — не опечатка, а фонетически точная запись.