Фамилия Халляев образована по старой тюркской модели: к основе Халляй добавили русский патронимический суффикс -ев, который указывает на «сына» или «потомка». Такая схема типична для народов Поволжья, Урала и Кавказа, где русская администрация в XIX–XX веках оформляла фамилии местному населению. Сама основа Халляй — не самостоятельное имя, а диалектное сокращение арабского имени Халилулла, что переводится как «любимец Аллаха». В тюркских языках долгие имена часто ужимались до коротких обиходных форм: так Халилулла мог превратиться в Халляя, а от него уже пошла фамилия.

Есть и вторая версия, более прозаичная. В турецком языке слово halay обозначает народный круговой танец под зурну. Если принять эту гипотезу, то Халляем в селе могли прозвать искусного плясуна, заводилу на праздниках. Такое прозвище легко закреплялось за человеком, а затем переходило к детям уже как фамилия. Обе трактовки имеют право на жизнь, но первая выглядит убедительнее: личные имена в основе фамилий встречаются чаще, чем прозвища по танцу, к тому же имя Халилулла широко бытует у мусульманских народов, а вот halay — слово узкорегиональное, и вряд ли оно стало бы основой для фамилии за пределами турецкой среды.

В написании фамилии обращает на себя внимание двойное «л» — это след фонетики тюркских языков, где звук передаётся напряжённо и долго. При адаптации к русской графике его сохранили, что отличает Халляевых от более частых Халиловых и Халаевых, образованных от тех же корней, но без удвоения. Сегодня фамилия встречается редко, и это говорит о том, что род, вероятно, берёт начало из одного локального села или аула, где имя Халляй было в ходу у конкретной семьи. Точных сведений о знаменитых носителях нет, но само происхождение указывает на религиозную или танцевальную традицию предков — в зависимости от того, какой версии придерживаться.