Фамилию Халиляев чаще всего объясняют через арабское имя Халиль (خليل), которое переводится как «верный друг» или «близкий товарищ». В исламской традиции этот эпитет закрепился за пророком Ибрахимом (Авраамом), которого называют Халилуллах — «друг Аллаха». Имя было широко распространено среди народов, исповедующих ислам, и в России встречается у татар, башкир, народов Кавказа.

В основе фамилии лежит тюркская форма Халиляй (Халил + уменьшительно-ласкательный аффикс -ай). Этот суффикс характерен для тюркских языков: он превращает полное имя в более короткое, домашнее прозвище. К основе Халиляй добавили русский патронимический суффикс -ев, который указывал на принадлежность: «сын Халиляя». Так образовалась фамилия, которая буквально означает «потомок Халиляя» или «из рода Халиля».

Обратите внимание на написание: фамилия пишется через «я» (Халиляев), а не через «е» (Халилеев). Это не случайная ошибка — форма Халиляй закрепилась именно с гласной «я» в тюркской среде. Встречаются варианты Халиляев и Халилаев, но первый считается нормативным в русском языке, поскольку точнее передаёт исходное произношение.

Географически фамилия привязана к регионам с тюркским и мусульманским населением: её носители живут в Татарстане, Башкортостане, Дагестане, а также среди азербайджанцев. В дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать по-разному — Халиляев, Халиляевъ, иногда даже Халиляй, что отражает незавершённый процесс закрепления русского окончания.

Сословная принадлежность предков могла быть разной: от крестьян до купцов и духовенства, поскольку имя Халиль не было привилегией какого-то одного слоя. Единственное, что объединяет всех носителей фамилии, — это отсылка к имени, которое в исламе означает «друг Бога».