Фамилия Хамаганова — женская форма фамилии Хамаганов, и её происхождение ведёт нас напрямую в бурятскую языковую среду. В отличие от множества русских фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, основа здесь — этническая. Слово «хамаган» в бурятском и монгольском языках означает женщину-тунгуску, представительницу эвенкийского народа. Таким образом, прозвище Хамаган мог получить человек, у которого мать или жена была эвенкийкой, либо тот, кто жил среди эвенков и перенял их обычаи. В тюрко-монгольском мире такие прозвища были распространённым способом фиксации межэтнических браков или соседства.

Модель образования фамилии — суффикс -ов/-ев, самый массовый в русском ономастиконе. Однако в данном случае он прирастает не к славянскому корню, а к бурятскому этнониму. Это типичная история для фамилий народов Сибири и Забайкалья: русские чиновники и писцы при оформлении документов «обрусевали» местные прозвания, добавляя к ним привычное окончание. Поэтому Хамагановы — это почти наверняка потомки бурятских родов, получивших фамилию при массовом закреплении в XIX — начале XX века.

География фамилии подтверждает эту версию. Подавляющее большинство носителей сосредоточено в Бурятии, Забайкальском крае и Иркутской области. Встречаемость за пределами этих регионов — единичные случаи, связанные с миграцией. Интересно, что в русской среде фамилия не имеет никакой внутренней семантики: её невозможно осмыслить через славянские корни, что сразу выдаёт её иноязычное происхождение. Для сравнения: однокоренные бурятские фамилии вроде Хамганов или Хамнагадаев имеют ту же основу, но различаются суффиксами, отражающими разные варианты записи и диалектные особенности.

Споров о происхождении здесь почти нет. Версия, связывающая фамилию с монгольским «хамга» (щит, защита), менее убедительна: она не объясняет суффикса -ан и не подтверждается фамильной статистикой. Основное значение — «сын (или потомок) человека, связанного с эвенками» — лежит на поверхности и не требует натяжек.