Фамилия Ханчалова — женская форма, а её мужской вариант — Ханчалов. В основе фамилии лежит тюркское или кавказское имя Ханча, которое восходит к слову «хан» — титул верховного правителя у тюркских и монгольских народов. В этом случае имя Ханча могло быть уменьшительно-ласкательной формой от имени Хан, Хан-Мухаммед или других сложных имён с компонентом «хан». В тюркской традиции такие имена давали с пожеланием ребёнку власти, силы и благородства, хотя в быту «хан» могло быть и прозвищем — для человека властного, богатого или просто с гордой осанкой.

Суффикс -ов- в фамилии указывает на русскую модель образования — «чей?» (Ханчалов — сын Ханчи). Это говорит о том, что фамилия сформировалась на территории, где русская фамильная система наложилась на местные имена и прозвища. Вероятнее всего, носители фамилии — потомки тюркских народов (татар, башкир, кумыков, ногайцев), которые в XV–XVII веках вошли в состав Русского государства и постепенно переходили на русские фамилии. Встречается фамилия и у народов Северного Кавказа, особенно у чеченцев и ингушей, где имя Ханча (Ханчу) известно и сегодня — там оно могло быть самостоятельным именем, а не уменьшительной формой.

Второй вариант, менее вероятный, — связь с арабским словом «ханча» (кинжал). В таком случае прозвище могли дать оружейнику, воину или человеку с острым характером. Но для фамилии, закрепившейся в документах, имя-основа встречается чаще, чем прозвище по предмету.

Географически фамилия Ханчалова рассредоточена: её носители есть в Татарстане, Башкортостане, Чечне, а также в южных регионах России — в Ставропольском крае и Ростовской области. Встречается она и в среде поволжских татар, и у горских народов, что говорит о разных, но схожих по корню именах в разных культурах. Единого сословного происхождения у фамилии нет: предки могли быть и крестьянами, и служилыми людьми (например, татарскими мурзами, перешедшими на русскую службу).