Фамилия Ханявина — женская форма мужской фамилии Ханявин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Ханява. Основа здесь — диалектное слово «ханява», которое в северных и уральских говорах означало «раззява», «простофиля», «нерасторопный человек». Как и многие «обидные» прозвища, оно не обязательно указывало на реальные качества человека: в крестьянской среде такие имена часто давали как оберег, чтобы отвести от ребёнка злые силы. Считалось, что названный нерасторопным вырастет ловким и удачливым.

Словообразовательная модель типична для русского Севера и Поволжья: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Хани). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в южных и центральных областях, -ин характерен для территорий, где в основе лежали прозвища на -а/-я. Фамилия Ханявин — яркий представитель именно этой северной традиции.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с тюркским корнем «хан» (владыка, правитель). Тогда Ханява могло быть уменьшительно-пренебрежительной формой имени Хан, вроде «ханёнок» или «маленький хан». Однако фонетика и ареал распространения фамилии (она встречается в основном в Архангельской, Вологодской областях и в Пермском крае) говорят в пользу славянского происхождения от диалектного слова.

Интересно, что фамилия сохранила редкую для русского языка форму с мягким «н» перед «я»: «Ханявин», а не «Ханавин». Это указывает на устойчивую устную традицию в тех местах, где «я» в прозвище произносилось именно как мягкое. В XIX веке носители фамилии числились преимущественно государственными крестьянами, а в некоторых метрических книгах встречается написание «Хонявин» — с «о» вместо «а» под влиянием акающих говоров.