Фамилия Ханзатян — армянская по происхождению, и её разумно начать именно с указания этнической принадлежности, а не с разбора корня, потому что суффикс -ян (в старой орфографии -янц) однозначно выдает носителя армянской ономастической традиции. Этот суффикс — аналог русского -ов/-ев или грузинского -дзе: он указывает на принадлежность к роду, происхождение от предка. В диаспоре, особенно в среде армян, переселившихся в Российскую империю в XIX — начале XX века, фамилии на -ян нередко русифицировали, отбрасывая окончание, но Ханзатян сохранило исходную форму.

Основа фамилии — «Ханзат» — скорее всего, личное имя или прозвище. В армянском языке слово «хан» (խան) заимствовано из тюркских и персидского и означает правителя, князя или начальника. Вторая часть, «зат» (զատ), может восходить к армянскому «զատել» (зател) — «отделять», «разделять», либо к персидскому «заде» — «рожденный», «сын». Таким образом, Ханзат можно интерпретировать как «рожденный ханом» или «ханский сын» — титул или почетное прозвище, которое давали человеку знатного происхождения или тому, кто служил при хане.

Однако не стоит видеть в этом прямую аристократию. В армянской среде такие прозвища часто получали ремесленники, торговцы или воины, работавшие на ханских дворах или в регионах, где правили тюркские династии (например, в Карабахском ханстве или Эриванском ханстве). Фамилия Ханзатян могла закрепиться за родом, чей предок был управляющим, сборщиком податей или просто носил уважительное прозвище «Ханзат» за удальство или богатство.

Географически фамилия тяготеет к исторической Западной Армении и областям, входившим в состав Османской империи, а также к восточноармянским землям (современная Армения и Нагорный Карабах). После геноцида армян 1915 года многие носители фамилии расселились по всему миру, но в России и странах СНГ Ханзатян встречается реже, чем, скажем, Арутюнян или Петросян.

Словообразовательная модель проста: личное имя / прозвище Ханзат + суффикс принадлежности -ян. Ударение в армянском языке обычно падает на последний слог — ХанзатЯн, хотя в русской среде допустимо смещение на второй слог. В дореволюционных записях фамилия могла писаться как Ханзатьянц, с сохранением древнего суффикса родительного падежа множественного числа.

Если искать параллели, то однокоренные армянские фамилии — Ханян, Ханикян, Ханданян — все они так или иначе восходят к титулу «хан». Ханзатян стоит в этом ряду особняком из-за составной основы, что делает её более редкой и конкретной по значению.