Фамилия Ханженков — редкий пример, где за привычной русской фамильной формой стоит нерусская, тюркская основа. Это фамилия, которая говорит о смешении культур на южных рубежах России.

В основе лежит прозвище Ханжа. В русском языке слово «ханжа» имеет два значения: прямое — мусульманский паломник, совершивший хадж (от арабского «хаджжи»), и переносное, более позднее — лицемер, притворно набожный человек. Для фамилии первично, конечно, первое значение. Так могли прозвать человека, побывавшего в Мекке, или выходца из татарской, башкирской или кавказской среды, носившего почетное прозвание «хаджи». Суффикс -енков указывает на патронимическую модель, распространенную на юге и востоке России, особенно среди казачества и в бывших «украинных» землях. Это уменьшительная форма: Ханженков буквально означает «внук (или сын) маленького Ханжи», то есть потомок человека по прозвищу Ханжа.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к Донскому краю и южным областям России. В документах XVIII–XIX веков Ханженковы встречаются среди донских казаков. Известен, например, казачий полковник Иван Ханженков, участник Кавказской войны, что подтверждает связь фамилии с военно-служилым сословием. Встречается она и в бывшей Екатеринославской губернии. Таким образом, предки современных Ханженковых с высокой вероятностью были либо казаками, либо крестьянами, переселившимися на южные земли, где и усвоили местную модель образования фамилий на -енков.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые встречаются повсеместно, суффикс -енков сразу выдает регион происхождения — это южнорусские и украинские земли, где он был особенно продуктивен. Однокоренные фамилии — Ханжин, Ханжов, Ханжиев — встречаются реже и имеют другую географию. Ханженков же стоит особняком: сочетание тюркского корня с «малороссийским» суффиксом делает его ярким свидетельством культурного и языкового пограничья, где оседали люди разных вер и народов, постепенно вливаясь в русское служилое сословие.