Фамилия Хара в большинстве случаев — это краткая просторечная форма канонического имени Харитон. С греческого оно переводится как «щедрый», и именно эта основа, а не что-то экзотическое, чаще всего лежит в фамилии. Такое сокращение имени до первого слога или корня — типичная народная традиция: Харитон в обиходе превращался в Харю, а затем и в Хару. Поэтому предок носителя этой фамилии, скорее всего, был человеком простого звания, которого в быту звали не полным именем, а коротко и привычно.

Вторая версия происхождения ведет фамилию к прозвищу, образованному от бурятского слова «хара» — «черный». В этом случае прозвище могли дать человеку за смуглую кожу, черные волосы или пристрастие к темной одежде. Однако у этого корня есть и социальный оттенок: в некоторых тюркских и монгольских традициях «черный» противопоставлялся «белому» как простолюдин — знатному, или как платящий подати — свободному от повинностей. Так что прозвище Хара могло указывать и на зависимое положение человека. Впрочем, эта гипотеза выглядит менее правдоподобной для русской фамилии: географически бурятское влияние на формирование фамилий центральной России маловероятно, тогда как имя Харитон было распространено повсеместно.

Интересно, что при таком коротком корне фамилия не получила типичного русского суффикса -ов или -ин. Это говорит о том, что форма закрепилась в том виде, в каком человека называли в обиходе, без добавления «сын такого-то». Подобные «голые» фамилии встречаются реже, но они особенно ценны для историка: они сохранили именно живое прозвище или сокращение, а не книжную форму.