Фамилия Харабаджахян — редкий случай, когда армянское происхождение читается сразу, но корень ставит в тупик даже подготовленного читателя. В отличие от массы фамилий на -ян, образованных от имён (Петросян, Акопян) или профессий (Назарян — «плотник»), здесь основа неочевидна. Разберём её по частям.

Первое, что бросается в глаза, — финаль -джяхян. В армянской ономастике элемент -джян (или -чян) часто указывает на профессию: например, Дарбинян («кузнец»), Чухаджян («сапожник»). В фамилии Харабаджахян этот суффикс видоизменён: -джахян, вероятно, восходит к тому же словообразовательному ряду. Основа харабад — самая спорная часть. Есть две версии.

Первая: «Харабад» — это искажённое арабское или турецкое «харабат» (развалины, руины). В османском контексте слово могло означать нечто ветхое или заброшенное, а в переносном смысле — «бедняк», «бродяга». Тогда Харабаджахян — «сын того, кто связан с развалинами», возможно, житель разрушенного квартала или человек, промышлявший разбором руин. Вторая версия отталкивается от того, что «хараба» в некоторых тюркских диалектах означает «чёрный», «тёмный». Тогда фамилия могла указывать на тёмный цвет волос или кожи предка. Обе гипотезы не противоречат армянской традиции давать фамилии по прозвищам, но первая выглядит убедительнее: в армянских фамилиях много следов быта и ремесла, а цветовые прозвища чаще оформлялись через другие модели.

Географически фамилия тяготеет к западноармянскому ареалу — территориям исторической Западной Армении (ныне восток Турции). Такие фамилии с тюрко-арабскими корнями характерны для армян, живших в Османской империи. После геноцида 1915 года носители фамилии рассеялись по диаспоре, поэтому сегодня Харабаджахян можно встретить в Армении, России, США, Ливане и Франции, но везде это редкая фамилия.

Что касается суффикса -ян, он стандартен для армянских фамилий и означает принадлежность: «из рода», «сын». Таким образом, фамилию стоит понимать как «потомок Харабаджа» (человека, получившего прозвище Харабадж). В русском языке фамилия сохраняет оригинальное армянское ударение на последний слог: Харабаджахя́н. В документах встречаются варианты написания с одной «а» (Харабаджян) или с «х» в конце основы, но исходная форма — полная, с двумя «а» и «х» в корне.